mercredi 7 octobre 2015

principaux acteurs impliqués dans la stabilité et la dégradation des protéines."

Partenaires improbables? Le système d'élimination des déchets de la cellule régule les protéines corps d'horloge
L'expression rythmique de gènes clés est essentielle pour maintenir un bon chronométrage de l'horloge du corps. En outre, la dégradation des protéines rythmique d'horlogerie est également cruciale. Cependant, de façon surprenante, les chercheurs savent peu de choses sur ces processus spécifiques.

Une nouvelle étude menée par Penn décrit un nouvel écran de génome qui a identifié des molécules de partenaires de protéines d'élimination cellulaire déchets. L'équipe dirigée par John Hogenesch, PhD, professeur de systèmes de pharmacologie et de thérapeutique translationnelle dans la Perelman School of Medicine de l'Université de Pennsylvanie et Jason DeBruyne, PhD, ancien boursier postdoctoral dans le laboratoire Hogenesch et maintenant professeur adjoint au Morehouse School of Medicine à Atlanta, appliqué leur nouvelle méthode pour l'identification d'autres partenaires d'horloge qui ciblent un récepteur de noyau cellulaire multifonction pour l'élimination. Leurs résultats ont été publiés en ligne avant impression dans les Actes de l'Académie nationale des sciences.

«Notre objectif n'était pas vraiment pour étudier la biologie horloge", a déclaré l'auteur principal Hogenesch. "Au contraire, notre objectif était de développer un écran l'échelle du génome pour identifier les principaux acteurs impliqués dans la stabilité et la dégradation des protéines."

Les protéines qu'ils cherchaient sont appelées ligases. Ceux-ci reconnaissent des protéines spécifiques et dirigent l'addition d'une molécule sur les protéines de déchets à être envoyé à la protéine d'être recyclé vers le protéosome. Ceci est le compartiment des cellules qui se décompose protéines utilisées dans les acides aminés basiques. Pour valider l'écran, l'équipe marqué plusieurs de leurs protéines d'horloge préférés avec une étiquette de protéine courte qui est facilement reconnu par les anticorps. L'équipe a ensuite utilisé l'imagerie à haut débit pour voir cette ligase augmenter et diminuer le niveau de leurs protéines d’horloge préférée dans les cellules. Ils ont constaté que la ligase Fbxl3 était un régulateur de protéines Cry, composants critiques de l'horloge de base. Ils ont également découvert qu'une protéine appelée Seven par contumace 2 (Siah2) est un régulateur clé du chiffre d'affaires, une protéine nucléaire d'horloge bien étudiée appelé RevErbα sur un cycle de 24 heures.

Certaines ligases, comme Fbxl3, peuvent être ciblés avec de petites molécules. "Ces ligases sont développés activement dans les efforts de découverte de médicaments", a noté Hogenesch. "La plupart des protéines ne se lient pas avec de petites molécules. Avec cet écran, nous pouvons être en mesure de surmonter cette limitation en trouvant la ligase qui régule leurs niveaux et fonction. Les petites molécules contre la ligase, puis, indirectement, pourraient réguler la quantité et donc l'activité de la protéine 'undruggable'. "

Les chercheurs espèrent que par l'application de cette nouvelle méthode, des objectifs plus de médicaments ligase peuvent être trouvés et mis au point de nouvelles thérapies à travers le spectre des problèmes de santé.