Ce est le meilleur moyen pour détecter la tuberculose et peut devenir la première ligne de contrôle, à condition qu'elle soit acceptée par la communauté médicale. Actuellement l'examen microscopique est la méthode la plus couramment utilisée dans les pays en développement. Cette technique est vieille de 100 ans et implique la coloration des crachats avec un colorant qui colore seulement de bactéries Mycobacterium tuberculosis, qui peut ensuite être examiné sous un microscope. Cette technique peut être utilisée dans des endroits avec des installations minimales de diagnostic, mais ne est pas très sensible à moins que la concentration de bacilles dans l'expectoration est élevé. Presque 60-80% des cas de tuberculose peut passer inaperçue avec cette méthode. Récemment l'Organisation mondiale de la Santé (OMS) a approuvé une nouvelle machine qui donne des résultats précis dans les 2 heures. Toutefois, ce dispositif coûte $ 17 000 et chaque test nécessite $ 17 cartouche. Des études menées à l'Université Western Michigan suggèrent que le rat de Gambie peut mieux faire. Cette espèce de rat peut sentir la différence entre les bacilles de la tuberculose et les autres germes qui peuvent être présents dans le flegme humain. Les échantillons utilisés lors de l'étude ont été ultérieurement confirmées par culture de laboratoire. On a trouvé que la sensibilité du rat à détecter correctement la présence de bacilles était aussi élevée que 86,6%, tandis que leur spécificité pour détecter l'absence de bacilles était plus de 93%. De même, lorsque le succès du rat a été comparé à la microscopie des frottis, il a été constaté que les rats étaient 44% plus précis à ramasser les cas positifs. Les rats doivent être formés pour faire le même quand ils sont environ huit semaines vieux échantillons de crachats. Les positifs et négatifs sont mis sous le trou de l'inhalation et quand les rats passent plus de cinq secondes sur un échantillon positif ils sont récompensés. En 26 semaines, les rats sont entraînés à passer plus de temps renifler les échantillons positifs et passer moins de temps dans les échantillons négatifs. L'auteur principal de l'étude et professeur de psychologie, le Dr Alan Poling dit que la fraternité médicale est encore sceptique quant à l'acceptation des animaux comme un outil de diagnostic raisonnable. Il a dit que la recherche sur les rats était encore au stade préliminaire, mais finalement, ils pourraient être utilisés dans le dépistage de première intention pour la tuberculose