L'écologie aquatique est une branche de la science de l'écologie qui s'intéresse à l'étude des écosystèmes aquatiques. Ce champ peut être divisé en deux divisions: l'écologie d'eau douce et l'écologie marine. Étant donné que la plupart de la Terre est recouverte d'eau, la compréhension des écosystèmes aquatiques est très importante, d'autant plus que l'eau est essentielle à la survie de toute vie sur Terre. Sans eau, la Terre serait un endroit très différent, et il ne serait probablement pas les écologistes autour de l'étudier. Écologie des eaux douces implique rivières, les lacs, rivières, plans d'eau saisonniers, les dépôts d’eau souterraine et les zones environnantes, tout en écologie marine est préoccupé par l'océan. Estuaires, où l'eau douce rencontre l'eau salée, peut être étudié par les écologistes de l'un des champs, et parfois les deux, travailler en collaboration sur des projets qui nécessitent l'expertise des écologistes d'eau douce et marins. Parce que les systèmes d'eau sont reliés entre eux, il y a beaucoup de coopération entre les professionnels travaillant dans divers aspects de l'écologie aquatique, et entre les écologistes aquatiques et d'autres membres de la profession écologie.
Que ce soit un écologiste travaille avec l'eau salée ou d'eau douce, il y a un certain nombre de sujets d'intérêt pour l'écologie aquatique. Des écologistes aquatiques étudier les populations naturelles d'organismes dans l'eau, l'apprentissage des variations naturelles et l'impact des influences telles que la température, la salinité, la profondeur de l'eau, l'emplacement et la saison. Les écologistes peuvent être intéressés particulier dans les organismes d'importance économique, ou dans la biologie d'un écosystème dans son ensemble.
Les écologistes aquatiques sont également intéressés par les interactions de l'homme avec l'environnement, et l'impact de l'activité humaine sur les écosystèmes aquatiques, allant de déversements d'hydrocarbures dans l'océan de ruissellement des terres agricoles dans les lacs et cours d'eau. Certaines activités humaines ont des conséquences inattendues, et ces conséquences peuvent prendre une dimension épique dans le monde de l'écologie aquatique, puisque toute l'eau se jette dans l'océan, et les océans du monde sont tous reliés. Un microbe dans le Gange peut se retrouver dans un port en Grande-Bretagne, et les écologistes peuvent explorer le chemin qui microbe fallu pour y arriver, et si oui ou non les activités humaines ont joué un rôle.
Il y a un grand nombre de domaines d'études à la disposition des personnes qui travaillent dans l'écologie aquatique, y compris la conservation de l'eau, préservation de l'environnement, utilisations commerciales des ressources aquatiques, la pollution, l'histoire de l'utilisation de l'eau, les politiques d'utilisation de l'eau, et l'étude des organismes uniques dans divers les milieux aquatiques du monde entier. Les gens entrent généralement dans ce domaine en prenant un diplôme en écologie, en se concentrant sur les questions aquatiques d'intérêt, avec une formation de pointe dans la poursuite d'études supérieures de recevoir des qualifications additionnelles et de l'expérience.