En deux dimensions (2D) électrophorèse sur gel est une méthode scientifiques utilisent pour démonter et analyser des mélanges de protéines en premières bandes de séparation des protéines selon deux axes différents. Il s'agit d'une technique qui est le plus souvent utilisé lorsqu'il s'agit de mélanges complexes de protéines ou épais, souvent avec chevauchement tailles des protéines. Électrophorèse sur gel 2D diffère de gel d'électrophorèse à une dimension, car la première méthode utilise la séparation de protéines sur la base de deux caractéristiques différentes de protéines, alors que l'électrophorèse sur gel unidimensionnelle sépare généralement des protéines sur la base d'une caractéristique unique, comme la taille des protéines.
Électrophorèse sur gel est souvent utilisée dans la recherche pour séparer les molécules en utilisant le fait que de nombreuses molécules biologiques, comme l'ADN, ont une charge électrique. Ce fait peut être utilisé à l'avantage des scientifiques parce que les molécules chargées peuvent être séparés selon leur taille par le biais d'un substrat poreux comme agarose en appliquant un gradient de tension à travers un matériau poreux, gel ionique. Au fil du temps, les molécules passeront par ce gel, en direction de la charge qui est opposée à la charge naturelle de la molécule. Les petites molécules et les molécules fortement chargées à la fois plus vite que les grosses molécules ou des protéines qui sont faiblement chargées. Électrophorèse sur gel en 2D, après séparation des protéines par une caractéristique unique, ce qui crée un gradient, un gel peut alors être tourné sur le côté pour séparer les bandes précédemment obtenues sur la base d'une seconde caractéristique.
Électrophorèse sur gel 2D utilise souvent les frais moléculaires des protéines comme une caractéristique par laquelle les agrégats de protéines peuvent être séparés en protéines à un seul composant. Masse protéique est une autre caractéristique commune utilisée pour séparer les protéines par électrophorèse sur gel 2D. Après protéines sont exécutés sur un gel à travers une seule voie dans électrophorèse sur gel unidimensionnelle, ce gel peut ensuite être tourné dans une centrifugeuse, tirant les protéines les plus lourds vers le bas plus vite que les petits, les protéines moins massives. La direction de la traction est perpendiculaire à la direction des protéines ont été tirées à travers le gel due à l'attraction d'une charge électrique à travers un gradient de tension. L'électrophorèse a de nombreuses utilisations dans les études moléculaires, y compris la séparation des protéines en fonction des caractéristiques de synthèse, comme l'étiquetage des protéines. Séparation des protéines sur la base d'une caractéristique de masse est également utilisée lorsque les protéines sont étiquetées avec d'autres molécules. Cette technique peut être utilisée avec ces complexes protéiques parce que les protéines marquées tomberont plus facilement à travers un gel de protéines non marquées.
Bien que les gels de séparation nombreux laboratoires soient en agarose, la séparation des protéines par électrophorèse sur gel 2D est mieux fait sur des gels de polyacrylamide. Ces types de gels sont utilisés dans le Western Blot et d'autres protéines fondés sur la taille des dosages. L'agarose est le plus souvent utilisé pour la séparation des segments d'ADN.