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mercredi 2 janvier 2013

Qu'est-ce qu'un micro réseau d'ADNc?

Un microréseau d'ADNc est une méthode de déterminer quels gènes dans une cellule sont actifs à un moment donné. Ceci est utile pour distinguer les gènes qui agissent différemment dans différents types de cellules et aussi quels gènes sont actifs dans certaines conditions, telles que le cancer. Le nom d'ADNc dérive de l'utilisation de l'acide désoxyribonucléique petite (ADN) qui collent à l'acide ribonucléique (ARN) que les cellules expriment. Ces petites séquences d'ADN sont complémentaires (c) les séquences d'ARN, d'où le collant, et ils sont aussi marqués avec des étiquettes fluorescentes, si un expérimentateur peut voir des séquences d'ARN qui sont exprimés et dans quelle mesure.

Les cellules contiennent de l'ADN comme un modèle pour toutes les protéines d'une cellule a besoin. La séquence de l'ADN représente les acides aminés que le corps a besoin de rassembler et de faire pendre une protéine. Fabrication entre l'ADN et la protéine est une étape intermédiaire. La cellule copie de la séquence du gène dans une autre forme appelée ARN messager (ARNm). Ensuite, la machinerie cellulaire se lit comme instructions de l'ARNm de la protéine désirée.

Comme l'ARNm de gènes particuliers n’est pas tous exprimés en permanence, les généticiens peuvent regarder ce qui est exprimé sous certaines conditions. Il peut être utile de comparer les cellules tumorales des cellules saines et de voir quels gènes expriment l'ARNm différemment dans les deux situations. Cette information peut ensuite pointer vers des cibles scientifiques pour les traitements. Différents types de cellules produisent également des modèles d'ARNm différents, car chaque type de cellule a un travail différent.

La base d'un micro réseau d'ADNc est que le test identifie l'ARNm exprimé à partir d'un échantillon d'une sensibilité qui permet à l'expérimentateur de déterminer quels sont les gènes exprimant plus que d'autres et qui ne sont pas du tout exprimer. Comme un micro réseau d'ADNc teste habituellement des centaines de milliers de séquences d'ARNm, il est généralement fait à la machine. L'analyste ne pas utiliser l'ARNm il extrait d'une cellule directement, mais fait plutôt une copie de cet ARNm en une séquence d'ADN.

Les sociétés commerciales fabriquent  des plaques de micro réseaux d'ADNc pour les laboratoires à utiliser. Ils font les séquences d'ADN qui correspondent à des centaines ou des milliers de gènes que l'expérimentateur souhaite tester et mettre chacun individuellement sur une lame de puces à ADN unique. Cela représente l'ensemble des gènes qui pourraient être exprimées dans ce groupe.

Des séquences complémentaires de l'ARNm que les extraits de chercheur de la cellule sont ensuite réalisés en laboratoire en copiant l'ARN en ADN. Ces produits ont une séquence qui colle à l'ADN sur la diapositive puce à ADN qui aurait produit l'ARNm. L'analyste se fixe alors des molécules fluorescentes sur ces séquences d'ADNc.

Couvrant la glissière puce à ADN dans l'ADNc permet des séquences complémentaires à coller ensemble. La lame est ensuite lavé pour éliminer les non liée ADNc. Dispositif de balayage mesure alors la quantité de fluorescence, le cas échéant, sur chaque point de l'ADN. Gènes qui expriment l'ARNm de plus auront plus de fluorescence ADNc lié à eux que des gènes qui expriment l'ARNm de moins. De cette façon, l'analyste peut déterminer quels gènes sont plus actifs que d'autres et comparer les résultats à un type cellulaire différent.