La cause exacte de l'endométriose n’est pas connue, mais les chercheurs ont certaines théories.
Il peut résulter de quelque chose appelé "flux menstruel rétrograde", dans lequel une partie du tissu qu'une femme met au cours de sa période circule à travers ses trompes de Fallope dans son bassin. Alors que la plupart des femmes ont un certain flux menstruel rétrograde pendant leurs périodes, toutes ces femmes n’ont pas l'endométriose. Les chercheurs tentent de découvrir ce que d'autres facteurs pourraient causer le tissu à attacher et développer chez certaines femmes, mais pas dans d'autres. Les chercheurs croient que l'endométriose résulte probablement d'une combinaison de facteurs, y compris (mais sans s'y limiter) certains des éléments suivants:
• Parce que l'endométriose est héréditaire, gènes sont probablement impliqués avec l'endométriose dans une certaine mesure.
• L'œstrogène (une hormone impliquée dans le cycle de reproduction féminin) contribue également susceptible d'endométriose, parce que l'endométriose est une maladie inflammatoire dépendant des œstrogènes.
• Dans l'endométriose, l'endomètre peut ne pas répondre comme il se doit à la progestérone, une autre hormone impliquée dans le cycle reproducteur féminin. Cela signifie que l'endomètre a «résistance à la progestérone."
• Dans certains cas, de l'endométriose, le système immunitaire ne parvient pas à détruire les tissus de l'endomètre, ce qui lui permet de se développer à l'extérieur de l'utérus. Cela signifie que le dysfonctionnement du système immunitaire joue un rôle dans ces cas.
• Les expositions environnementales dans l'utérus, comme à des produits chimiques comme la dioxine, ont également été associés à développer une endométriose