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samedi 9 mars 2013

Qu'est-ce que la quantification d'ARN?

L'acide ribonucléique (ARN) de quantification est un moyen de détermination de la concentration moyenne de l'ARN dans une solution. Cette détermination peut être effectuée en utilisant une variété de méthodes, qui tombent généralement dans l'une des deux catégories: spectrophotométrie ou fluorescent quantification colorant. La spectrophotométrie repose sur la capacité de l'ARN d'absorber certaines longueurs d'onde de la lumière ultraviolette. Certains des colorants fluorescents, tels que le bromure d'éthidium, peut se lier à des acides nucléiques tels que l'ARN, et une fluorescence quand ils sont liés, en permettant la luminosité à mesurer.

Lorsque l'ARN est exposé à la lumière ultraviolette, il absorber sélectivement cette lumière aux longueurs d'onde de 260 nanomètres (nm) et 280 nm. Ce procédé est effectué dans un spectrophotomètre, ce qui produit des longueurs d'onde de la lumière ultraviolette, et mesure la lumière qui passe à travers l'ARN. De plus grandes concentrations d'ARN va absorber plus de lumière.

Une combinaison de ces deux longueurs d'onde est souvent utilisée dans la quantification d'ARN puisque cette méthode permet aux chercheurs de savoir si un échantillon est contaminé par d'autres macromolécules telles que les protéines. Ces contaminants sont souvent absorbent sélectivement la lumière 280nm, mais pas la lumière à 260 nm. Par conséquent, le calcul du rapport de la lumière absorbée à deux longueurs d'onde permet de déterminer le degré de contamination.

La quantification d'ARN utilisant des colorants fluorescents donne des résultats qui sont moins sensibles à certains contaminants, et peut être utilisé avec de faibles niveaux d'ARN qui rendraient impossible spectrophotométrie. Les colorants comme le bromure d'éthidium se lie à l'ARN, et la luminosité qui en résulte peut être mesuré directement à l'aide des photomètres de fluorescence. Si un photomètre n'est pas disponible, des solutions avec des concentrations connues d'ARN peut être préparé, et la luminosité de l'échantillon inconnu peut être à peu près par rapport à celles-ci. La relation entre la luminosité et la concentration d'ARN est linéaire, les chercheurs afin de déterminer rapidement une mesure de la concentration de la luminosité.

La quantification ARN en utilisant soit la méthode peut être très sensible à différents contaminants. Protéines, phénol, et les particules de grande taille peuvent tous les résultats de la spectrophotométrie inexacte. Ces contaminants n'affectent pas fluorescent colorant quantification ARN, mais cette méthode peut être rendue imprécise par la présence de l'acide désoxyribonucléique (ADN) dans un échantillon.

Des colorants qui se fixent les acides nucléiques se lient à la fois de l'ADN et l'ARN, et présentent des luminosités similaires, assurant ainsi un échantillon propre de l'ARN est important. La façon habituelle d'y arriver est d'ajouter une enzyme qui détruit l'ADN, comme la DNAse, à un échantillon mixte avant d'ajouter un colorant. En fonction de la concentration d'ARN dans un échantillon, et qui contaminants sont présents, les laboratoires peuvent utiliser l'une de ces méthodes pour quantifier l'ARN.