Il n'y a pas de consensus à propos de l'inventeur du microscope premier composé. La plupart des autorités estiment que l'instrument a été inventé par le spectacle néerlandais et fabricant de lunettes Zacharias Janssen, en Midddleburg, en Hollande vers 1595, avec certains estimant qu'il a été aidé par son père Hans Janssen - les deux ont travaillé ensemble à la conception et la construction des lunettes et lunettes. Certaines autorités d'autres, cependant, croient que Hans Lippershey, un allemand vivant dans la même ville, et aussi une machine à spectacle, a inventé le microscope premier composé à la même époque, mais il est crédité d'inventer le télescope, il ne fait aucun doute beaucoup plus sur son invention du microscope. On pense probable que Lippershey et les Janssens, qui se connaissaient, toutes les idées ont contribué au développement de ces deux instruments.
Le microscope composé utilise au moins deux lentilles distinctes pour fournir un grossissement beaucoup plus grande que ce qui est possible avec un seul. Il est constitué d'une lentille relativement puissante avec une courte focale - connu comme l'objectif - et une lentille de plus, mais moins puissant avec une longueur focale relativement longue, connu sous le nom de l'oculaire. Les deux lentilles sont normalement reliées par un tube, l'objet à examiner est placé sous la lentille d'objectif et mise en évidence par réglage de la distance à l'objet.
Les Janssens, en raison de leur profession, aurait été au courant de la fabrication et les propriétés des lentilles, et l'on pense que le microscope premier composé peut-être sortis de leurs tentatives de construire des lunettes plus puissantes. Aucun des premiers instruments de la Janssens ont survécu, mais le microscope premier composé encore en existence peut être vu au musée Middleburg et est pensé pour avoir été faite par les Janssens. Il n'a pas beaucoup ressemblé à un microscope moderne avec un stand, une scène sur laquelle les échantillons peuvent être placés et interchangeables lentilles de l'objectif d'offrir une gamme de grossissements. Au lieu de cela, elle ressemble à un petit télescope en ce qu'il est constitué de deux tubes, chacun avec une lentille à une extrémité, qui s'est tenue dans un tube un peu plus large, afin qu'ils puissent être déplacés d'avant en arrière pour se concentrer sur l'objet d'intérêt et faire varier le grossissement . Bien que ce microscope a été clairement conçu pour être tenu à la main, il y a des références à un autre des premiers microscopes, construit par les Janssens, qui s'élevait sur un trépied et aurait probablement ressemblait plus à l'instrument moderne.
Le microscope composé plus tôt survivant ne pouvait grossir les objets d'environ trois fois jusqu'à environ neuf fois. Néanmoins, il fonctionne sur les mêmes principes que le microscope moderne et ouvert la voie à la mise au point d'instruments qui fournissent des grossissements beaucoup plus élevés, ouvrant un monde jusqu'alors inconnu microscopique. Plus tard, au 17ème siècle, un autre scientifique néerlandais amateur, Anton van Leeuwenhoek, utilisé des microscopes de sa propre conception d'étudier les microorganismes dans les gouttes d'eau, mais bien plus puissant que les microscopes composés de la Janssens, Leeuwenhoek avait qu'un seul, lentille sphérique. Le scientifique britannique Robert Hooke, un contemporain de Leeuwenhoek, fait un certain nombre d'améliorations au microscope composé qui a permis à des grossissements beaucoup plus élevés à atteindre. Ses 1665 documents Micrographia de travail ses observations d'insectes, des cellules et des micro-organismes, et a aidé à établir le microscope composé comme un instrument essentiel pour les scientifiques.