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vendredi 15 mars 2013

Qu'est-ce qu'un transcriptome?

Le transcriptome est une collection complète de l'ARN à partir d'un organisme, un groupe de cellules, ou même une cellule spécifique. L'ARN est synthétisé à partir de l'ADN à travers un processus connu sous le nom de la transcription. L'ARN présent dans une cellule et détermine les corps dont les gènes seront exprimés, et ça change tout au long de la vie d'un organisme, contrairement à l'ADN, qui reste statique. Pression sur l'environnement est l'un des principaux motifs de changements, que le corps tente de s'adapter à des situations changeantes de l'environnement pour se maintenir en fonctionnement.

Le transcriptome est beaucoup plus petit que le génome d'un organisme, la collection complète de l'ADN dans l'organisme. En termes simples, on pourrait penser de l'ADN comme un livre de cuisine, en énumérant une collection complète de recettes qui peuvent être faites. Le transcriptome est le code qui détermine les recettes vont être faites, et quand. Le livre de cuisine reste statique tout au long de la vie, tandis que les variations du transcriptome en réponse à des facteurs environnementaux.

Une partie importante du transcriptome est molécules d'ARNm. L'ARN messager est un ARN qui communique avec les ribosomes dans les cellules pour diriger les cellules pour fabriquer des protéines différentes. Ces protéines sont utilisées pour une grande variété de fonctions. D'autres parties ne peuvent pas directement le code pour la production de protéines, mais faire des choses comme la détermination de la structure cellulaire et régulation de l'expression génique. Ensemble, les différentes composantes du transcriptome garder un fonctionnement de l'organisme et de déterminer l'expression des gènes au sein de cet organisme.

Dans différentes cellules dans le corps, le transcriptome peut être très différente. Les cellules du foie, par exemple, ont ARN qui fabrique les cellules du foie eux, et veille à ce que les cellules exercent des fonctions nécessaires. Les cellules de la peau, d'autre part, disposent d'un transcriptome différente qui active les gènes nécessaires pour fabriquer une cellule d'une cellule de la peau. Le foie et les cellules de la peau ont une copie complète du génome, mais leurs transcriptomes de déterminer quelles parties du génome sont activés.

Tout comme avec l'ADN, il est possible d'ARN de séquence. Le séquençage du transcriptome peut être fait pour en apprendre davantage sur les actions d'une cellule et l'ADN de l'organisme hôte, et d'identifier les endroits où l'expression de l'information génétique se passe mal. Quand une cellule devient maligne du foie, par exemple, c'est parce que le transcriptome ne fonctionne pas comme il se doit, et les gènes de malignité sont devenus activé, ou les cellules n'ont pas de réglementation en quelque sorte, les obligeant à se développer hors de contrôle. Le séquençage de l'ARN dans une cellule maligne peut aider un chiffre chercheur sur lesquels le gène a été activé ou désactivé pour que la malignité.