Un marqueur moléculaire, appelée aussi un marqueur génétique est une séquence particulière d'acide désoxyribonucléique, ou ADN, qui est identifiable dans le cadre d'un génome entier. Les chercheurs utilisent des marqueurs moléculaires pour garder la trace de l'emplacement des gènes particuliers ou d'autres séquences d'ADN notables au sein d'un grand brin d'ADN. Certains marqueurs moléculaires ne peuvent être identifiés en examinant la séquence d'information génétique tandis que d'autres peuvent être identifiés par l'examen visuel d'un organisme. Ces marqueurs servent à plusieurs fins dans la recherche biologique, y compris ceux de nature académique et ceux qui sont plus thérapeutique. Les applications académiques pourraient impliquer le catalogage des gènes qui affectent traits particuliers tandis que les applications thérapeutiques impliquent la recherche de marqueurs pour aider à identifier les variations génétiques dans l'espoir de traiter la maladie.
Il y a beaucoup de différents types de marqueurs moléculaires de différentes longueurs et configurations qui peuvent être utilisés à de nombreuses fins différentes. Certains se produisent naturellement tandis que d'autres sont spécifiquement développées par les chercheurs pour marquer les positions de certaines séquences d'ADN. Les différents procédés de laboratoire peuvent être utilisés pour ajouter des marqueurs moléculaires des séquences d'ADN particulières ou pour épisser les brins d'ADN à des points indiqués par la présence de marqueurs moléculaires. L'application de certaines techniques basées sur ces marqueurs permet aux chercheurs de faire des «cartes génétiques", contenant codé un organisme donné de l'information génétique.
Les marqueurs moléculaires doit posséder quelques traits distincts afin d'être utiles aux chercheurs. Par exemple, ils doivent être faciles à localiser et à identifier avec certitude, que le doute pourrait appeler les résultats définitifs des expériences basées sur les marqueurs en question. Ils doivent également être polymorphe, ce qui signifie que les différentes formes du gène codé par le marqueur existent dans différents organismes de la même espèce et se traduire par une certaine forme de changement dans les organismes. En général, il y a peu d'informations à tirer de non polymorphes sites. En outre, les polymorphismes conduire à des changements visibles, comme la couleur des yeux ou de la structure de l'aile, qui peuvent être utilisés pour identifier les organismes qui ont le maquillage génétique particulier.
Les différents procédés de la recherche biologique utilisent des marqueurs moléculaires pour une large gamme d'applications. Ils sont couramment utilisés pour tenter de déterminer comment certains traits physiques ou de troubles sont liés à des variables génétiques. Parfois, cela se fait à des fins purement académiques, car les chercheurs sont souvent intéressés pour déterminer quels gènes interviennent à qui les traits physiques. Il peut également être utilisé à des fins thérapeutiques, cependant. Certaines variations génétiques, par exemple, peut conduire à la maladie, donc enquêter sur les variations de marqueurs moléculaires polymorphes peut conduire les chercheurs à une idée sur la nature des maladies génétiques.